La Communauté de Communes est administrée par un Conseil de Communauté comprenant 49 délégués, élus par les 24 communes membres à raison d'un délégué titulaire et d'un suppléant par tranche de 500 habitants avec au moins un représentant et son suppléant par Commune.

Le Conseil de la Communauté se réunit plusieurs fois par an pour adopter les différentes délibérations concernant le fonctionnement de la CCJA : Niveau d'imposition, choix des investissements, vote du budget… et toutes décisions relatives à l'avenir de la Communauté. Chaque Conseil fait l'objet d'un Procès Verbal diffusé à l'ensemble des 49 élus et consultable par tout habitant du territoire de la CCJA.

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Composition du conseil de la communauté :